喝得醉醺醺的霍蜜兒(郭曉婷 飾)假裝溫柔地靠近嚴達慶(王品一 飾)，把他的配槍拔了出來，逼著嚴達慶離開辦公室。

嚴達慶離開之后，趕緊打電話給霍然(屈剛 飾)，誣陷程慈航(喬振宇 飾)妄圖把霍蜜兒灌醉欲行不軌?；羧徊淮笈?，立即要到警察廳找程慈航算賬。霍然趕到警察廳，看見女兒和程慈航互相攙扶著出來，生氣地指著程慈航大罵，要依法處理程慈航。霍蜜兒趕忙把霍然推開，程慈航勸霍蜜兒回家，任性刁蠻的霍蜜兒乖乖地上車。

冒充許老二義弟周亢的程慈航在街上看到一個熟悉的身影，他立即辨認出是那日和哈金斯會面的人，連忙跟了上去。這人正是混入錦線內(nèi)部的日本特務宮本，錦線弟子發(fā)現(xiàn)他的行蹤，立即進行圍攻。危難時刻，程慈航出手把倒在地上的宮本救了下來。

酒桌之上，程慈航和宮本都沒有把真實姓名告訴對方，程慈航謊稱自己是為五九檔案才千里迢迢來到南京。宮本受程慈航的救命之恩，加上他武功高強，宮本馬上答應和程慈航聯(lián)手查找五九檔案。這一幕都被一直尾隨程慈航的劉猛看到，他認出和程慈航在一起的是殺人犯劉振亮(周翔 飾)，趕忙告訴嚴達慶這一情況。嚴達慶決定公報私仇，把程慈航的問題徹底解決。酒酣耳熱的程慈航發(fā)現(xiàn)趕來的警察，二人慌忙跳窗而逃，逃到一所小院，程慈航發(fā)現(xiàn)無路可逃，他掩護宮本先逃。面對愛情和事業(yè)的雙重競爭對手，嚴達慶一槍托就把程慈航額頭砸得鮮血直流。忍無可忍的程慈航一把奪過嚴達慶手中的槍，把他摁倒在地，看到關天平(司源 飾)講情，想到同事一場，程慈航?jīng)Q定放嚴達慶一馬。不成想嚴達慶撿起槍又沖著程慈航連開數(shù)槍——彈匣已被程慈航卸下。

程慈航受傷，歐陽倩(安以軒 飾)抓緊時間幫他處理傷口，霍蜜兒則要找嚴達慶算賬。莫采石(巫剛 飾)得知嚴達慶又對程慈航下死手，警告嚴達慶如有下次定會讓他生不如死。等到霍然來到警察廳，莫采石拿出嚴達慶要求法辦程慈航的報告讓霍然決定，霍然假裝生氣讓嚴達慶陳述事實。程慈航以借許老二之名發(fā)現(xiàn)線索而又不愿暴露身份為由解釋事情原委。莫采石對程慈航做出停職處理，老奸巨猾的霍然只好停嚴達慶一月薪水。各打五十大板，暗中較量的總長和廳長找到了平衡點。

接受馬副官建議的莫采石暗中給程慈航置辦了一處新的居所，他像父親對兒子一樣對程慈航關懷備至。

戴罪立功的宮本準備找一些江湖人士，從南京的高官府邸和各大使館搜查五九檔案的下落，并栽贓錦線。不幾天，南京就接連發(fā)生大使館被盜案件，霍然斥責莫采石辦事不力。手下無人，莫采石也束手無策?；羧恢缓米屇墒謴统檀群铰殑眨⒂勺约鹤鰢肋_慶的工作。壓力極大的霍然坐鎮(zhèn)警察廳催促辦案，竟然接到霍蜜兒找程慈航的電話。

程慈航得以名正言順地勘察現(xiàn)場，均發(fā)現(xiàn)遺留有一種同樣的花瓣。程慈航認為這應該是某個團伙的標志，歐陽倩假裝不知。其實她一眼就看出這是錦線的標志——曇花，她想不明白到底是誰栽贓陷害錦線，她趕忙讓齊掌柜讓師傅出山。

程慈航推斷飛賊的目的應該是五九檔案，他急于到中央植物院弄清這種花到底是什么，歐陽倩借口整理材料不愿和他一起去。程慈航剛出警察廳大門就遇到霍蜜兒，霍蜜兒幫程慈航打通關節(jié)進入中央植物院，植物院劉院長告訴程慈航，這種花是曇花，很少有人見過。